El Inbiotec de León consigue mejoras en la elaboración de genotecas de la bacteria 'Streptomyces'
AMR/DICYT La mejora de procedimientos permite también hacer progresar los resultados científicos. Bajo esa premisa, un equipo de investigadores del área de Microbiología del Departamento de Biología Molecular de la Universidad de León y del Instituto de Biotecnología de León ha realizado arreglos en la elaboración de la genoteca, el conjunto de clones en los que está contenido el genoma de un organismo, de una especie del género Streptomyces productora de un componente de un fármaco utilizado como inmunosupresor en trasplantes. Los arreglos en el prodecimiento ya están siendo utilizados en el Inbiotec y la Biotehniška fakulteta (Facultad de Biotécnica, en castellano) de la Universidad de Liubliana.
El uso de genotecas en las investigaciones científicas es habitual cuando no está secuenciado totalmente el genoma de una especie. Éste es el caso en el género Streptomyces, una bacteria que produce metabolitos secundarios con interés comercial e industrial en Farmacología, muy investigada en el Inbiotec. Las genotecas se elaboran a partir de la aislación del genoma de una especie a través de la fragmentación de su ADN (ácido desoxirribonucleico). Utilizando cósmidos, vectores de clonación que admiten hasta 40.000 pares de bases de ADN, se clona cada fragmento y se introduce en una célula huésped. En este caso, el hospedante es Escherichia coli, un organismo modelo ampliamente utilizado en el ámbito científico.
El nuevo procedimiento, desarrollado por Miriam Martínez Castro, Elena Solera, Juan Francisco Martín y Carlos Barreiro, supone distribuir las 1.656 colonias de Escherichia coli portadoras de fragmentos de ADN de Streptomyces en 18 placas. Cada una de las placas contiene 96 pocillos, por lo que "podemos buscar el gen que necesitamos de forma más eficiente en cada una de estas placas a través de técnicas de hibridación o de PCR", explica a DiCYT Martínez Castro, primera autora de un artículo que recoge las mejoras de procedimiento y ha sido publicado recientemente en la revista científica Journal of Microbiological Methods. En conjunto, los ajustes permiten reducir la búsqueda de un gen concreto a uno o dos días y ahorrar el uso de instrumental científico. Antes se tardaba aproximadamente tres días en ordenar una genoteca para realizar la misma búsqueda.
Interés por los cambios
Varios grupos del Inbiotec ya han comenzado a aplicar la nueva metodología. Asimismo, la Biotehniška fakulteta de Liubliana se ha mostrado interesado en los arreglos de tipo piramidal que ha desarrollado el equipo científico de León, debido a una estancia de Martínez Castro en esta facultad. "Aún es pronto para conocer si otros grupos han empezado a utilizar el nuevo procedimiento, ya que la publicación del artículo científico ha sido muy reciente y aún no está citado", explica la investigadora. La mejora en el uso de las genotecas es habitual en el ámbito microbiológico.
El trabajo forma parte de una investigación más amplia que pretende aumentar la producción de un fármaco inmunosupresor denominado tacrolimus a través de cepas superproductoras de la especie Streptomyces sp. ATCC 55098. Este medicamento es ampliamente muy utilizado en trasplantes de hígado y riñón para evitar el rechazo. Los investigadores del Inbiotec han descrito ya genes de biosíntesis y han optimizado los medios de fermentación de la bacteria. Los primeros resultados son "poco concluyentes" y apuntan a que la esta especie es "poco productora".