Científicos de Salamanca y Barcelona participan en la creación de una base de datos internacional sobre proteínas
JPA/DICYT Científicos del Centro de Investigación del Cáncer (CIC) de Salamanca han participado en la creación de Human Proteinpedia, un portal para intercambiar datos relativos a las proteínas. La iniciativa pone a disposición de la comunidad científica un sistema de almacenamiento y centralización de información sobre secuencias de proteínas humanas. Los científicos salmantinos son los únicos españoles del proyecto junto al equipo de Genética Humana del Institut d’Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer (Idibaps) de la Facultad de Medicina de la Universidad de Barcelona. En total, 71 laboratorios de todo el mundo pueden publicar, modificar e intercambiar datos de estructuras proteicas indispensables para la investigación biomédica.
En la actualidad los científicos pueden acceder a una gran cantidad de información biológica a través de internet. Sin embargo, estas bases de datos no siempre cuentan con el aval de la evidencia experimental y, con frecuencia, se encuentran en distintas localizaciones, lo que dificulta la búsqueda y recuperación de información. De la necesidad de superar estas barreras nace esta wikipedia de las proteínas, un portal denominado Human Proteinpedia (www.humanproteinpedia.org), pionero en su género y que permite a los investigadores compartir de forma gratuita información relativa al conjunto de proteínas expresadas por el genoma humano, según la información del CIC recogida por DICYT.
Este nuevo recurso de información científica no hubiese sido posible sin la participación conjunta de 71 laboratorios de investigación genética y proteómica de todo el mundo, entre los que destaca el Grupo de Investigación de Genética Humana del Idibaps, de la Facultad de Medicina de la UB, integrado por Rafael Oliva, Juan Martínez-Heredia José Manuel Vidal que, junto a los grupos de Xosé Bustelo y Nieves Ibarrola, de la Unidad de Genómica y Proteómica del CIC de la Universidad de Salamanca representan la única participación española en esta iniciativa.
Compartir información
El principal objetivo de Human Proteinpedia es facilitar y potenciar el intercambio de información genética entre investigadores. Para ello, ofrece una visión estándar y centralizada del proteoma, es decir, de la totalidad de secuencias de proteínas codificadas por el genoma humano y de su información asociada. Así, los usuarios registrados pueden introducir, recuperar y compartir datos sobre secuencias, estructuras o mutaciones validadas por la evidencia experimental, ya que la información original sólo la puede modificar quien la introduce.
De esta forma, la información contenida en el nuevo portal, cuyo nacimiento acaba de ser publicado en la revista Nature Biotechnology, constituye una base de datos sin precedentes, que ayuda a comparar e interpretar secuencias de proteínas suministradas por el colectivo científico. La intención futura de esta herramienta, que lleva operativa alrededor de un año, es aglutinar y compartir la identificación y secuenciación de proteínas de estudios publicados, lo que permitirá avanzar en el estudio de los genes y de las proteínas implicados en numerosas patologías.