ProteoRed, 21 laboratórios ao serviço da pesquisa proteómica

José Pichel Andrés/DICYT O Instituto Nacional de Proteómica, ProteoRed, é uma plataforma de serviços proteômicos promovida pela Fundação Genoma Espanha que conta com seis pontos geográficos, um deles com sede em Salamanca, tratando de oferecer proximidade aos cientistas que utilizam os seus serviços de proteômica. O objetivo principal de ProteoRed é coordenar e desenvolver Serviços já existentes, oferecendo esta plataforma aos grupos de pesquisa espanhóis e fomentando o desenvolvimento de novas aplicações tecnológicas através dos 21 laboratórios que integram este projeto.

“A idéia é facilitar o acesso dos pesquisadores às técnicas proteômicas. Nossos laboratórios já estavam operando, mas desde a criação da plataforma percorremos um trajeto importante de estandardização e modernização tecnológica”, afirma Juan Pablo Albar, coordenador de ProteoRed desde o seu ponto central no Centro Nacional de Biotecnologia, Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), em Madrid.

ProteoRed está organizada em seis pontos que se dirigem desde Madrid, Bilbao, Barcelona, Salamanca, Valencia e Córdoba. No caso de Salamanca, o responsável pelo projeto é Xosé Bustelo, cientista do Centro de Investigación del Cáncer (CIC). Este centro atende à demanda de parte de Castela e Leão e da Galícia, que tem sede própria ligada a Salamanca.

“Nós não trabalhamos com um projeto de pesquisa diretamente, mas oferecemos serviços pontuais aos cientistas para experimentos que necessitem identificar as proteínas através de técnicas diversas como a espectrometria de massas, a eletroforese bidimensional ou a cromatografia líquida”, comenta o responsável. Não existe uma especialização por parte dos pontos nem dos laboratórios devido às próprias características dos serviços oferecidos pela plataforma, uma vez que o importante para os diferentes grupos de pesquisa é poder recorrer aos laboratórios mais próximos que lhes ofereçam o que necessitam com rapidez. Além do mais, a procura em cada ponto é bem heterogênia. Em todos os casos, dentro da estrutura ProteoRed existem grupos de trabalho especializados, somando um total de sete, que trabalham no aperfeiçoamento de diversos aspectos relacionados com o funcionamento de toda a plataforma.

Funções

As funções são a implantação tecnológica, as recomendações sobre o manuseamento e armazenamento de amostras, a promoção de experiências multicêntricas, o suporte bio-informático, o estabelecimento de preços e a organização funcional, a promoção e a difusão de técnicas de proteômica em geral, a internacionalização e conexão com plataformas européias e, finalmente, um grupo recentemente criado orientado a avaliar as novas técnicas biomédicas. “Para o futuro, devemos ir pensando que novas técnicas de análise podemos incorporar, de fato já existem diferentes formatos, como as micro-amostras (micro-arrays) de proteínas ou MS-imaging, mas a maioria ainda está longe de ser técnica robusta”, destaca Albar.

As diferentes técnicas proteômicas tratam de identificar as proteínas de uma célula ou organismo, determinar que funções têm e como se comportam perante diferentes situações, assim como analisam suas interações. O que é fundamental tanto para a pesquisa básica como para a orientada ao desenvolvimento de fármacos, entre outras. Além do mais, de acordo com o coordenador da plataforma, no momento atual é necessário “colocar o médico no centro da cena, porque existe muita demanda em Medicina para o uso das técnicas proteômicas”

Um projeto consolidado

Desde seu início em 2005, ProteoRed é um projeto que tem se “consolidado de forma notável”, segundo o coordenador geral, Juan Pablo Albar, que destaca o fato da plataforma ter sido reconhecida internacionalmente. “A foto inicial não é a foto final”, assegura, uma vez que o projeto partia com bastante “heterogeneidade na qualidade dos serviços” e foi necessário “fortalecer os fluxos de trabalho”. Apenas três anos mais tarde, ProteoRed pode se orgulhar de ter participado com êxito em competições internacionais de Proteômica que trabalham no fomento ao aperfeiçoamento das técnicas e dos serviços.

Estas provas consistem, por exemplo, em distribuir diferentes amostras entre as redes de vários países e estabelecer diferentes objetivos para ver que resultados as redes participantes são capazes de obter. Além disso, “submetemos à avaliação por um quadro de especialistas internacionais”, assinala Albar, algo absolutamente necessário, já que outro dos requisitos, que exigem muitas publicações internacionais aos cientistas para poder publicar, é que a qualidade das provas de Proteômica esteja contrastada.

Neste sentido, algumas técnicas como a espectrometria de massas, podem representar grande heterogeneidade, já que por vezes os resultados dependem do equipamento com que conta cada laboratório, de maneira que existem iniciativas internacionais para incorporar critérios de qualidade e transparência. Assim, ProtoRed mantém relações com outras plataformas européias e da Ibero-américa e entre as suas funções está também a organização de cursos, seminários e encontros para a divulgação de novidades, como as técnicas bioinformáticas, e a permanente atualização dos profissionais. Para o futuro, algumas perguntas passam pela possível especialização de alguns pontos ou laboratórios e inclusive por integrar-se mais em outras redes européias e internacionais, segundo Juan Pedro Albar.